在临床工作中，有些中青年男女会在男科或妇科检查时发现尖锐湿疣。他们原本是做其他检查，但由于局部出现了典型的菜花状、鸡冠状或乳突状的赘生物，经验丰富的男科医生肉眼观察也能确诊。如果担心误诊，也可以再次转到皮肤科检查清楚。
(1)醋酸白试验：用棉签蘸3-5%医用醋酸液涂在受试皮损上及周围皮肤黏膜上，若2-5分钟后皮损处变为白色，而四周正常皮肤不变白，则判定为尖锐湿疣。
(2)病理检查：病理检查在尖锐湿疣检查中，属于准确度很高的一种方法。它从尖锐湿疣的症状着手，通过检查来判定是否为尖锐湿疣。
(3)细胞学检查：取阴道或宫颈损害组织涂片，做巴氏(Papanicolou)染色，可见到空泡化细胞及角化不良细胞。这两种细胞常混合存在，对诊断尖锐湿疣有一定价值。
(4)免疫组化检测：采用PAP法或ABC法等，用过氧化酶标记的抗体检测HPV抗原，组织切片经一系列处理，依次加一抗、二抗、酶标试剂，显色、复染后观察结果。表皮空泡细胞核内见有棕褐色颗粒状着色为阳性，其阳性率为百分之四十到百分之六十。
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